GLi scrocchi come dici te potrebbero essere dovuti da molte cose...Non penso proprio dalla scheda madre.
Piuttosto hai provato a diminuire il DiskBlockBufferSize a 32K??? Non so se in nuendo questo parametro esiste perchč non lo conosco...
Potrebbe anche essere una questione di latenza, specie se lavori con molte traccie una latenza molto bassa tipo 3/5 ms potrebbe essere eccessiva, prova a lavorare con una latenza di 10/12 ms sufficiente a mio avviso e non molto impegnativa.
Do per scontato che abbia ottimizzato al meglio la tua DAW, tipo che viene ottimizzata per lavorare in Background, servizi minimi indespensabili ... ect ect ect
una breve guida la trovi su www.musicxp.net
Ciao