Certo che è possibile devi mandare dei segnali midi al tuo effetto.

Di solito sono Program change per cambiare il preset dell'effetto se li ha.
Oppure Control change che sono comandi specifici per interagire con i paramentri da variare nel tuo multieffetto.

Nel mentre l'audio che esce dal tuo eff. lo puoi rimandare dentro al PC registrandolo in una traccia audio.

Insomma e solo questione di sapere il tuo eff. che parametri ha che sono gestibili da l'utilizzatore e cioè te.
una volta che tu sai che comandi vuole glieli mandi.