cmq non ho ben capito cosa vorresti fare....

ad occhi e croce farei così:
se hai un loop lungo e te vuoi l'effetto su di una sola parte spitti il o i loops in modo da lavorare sulle singole parti.

con lo strumento selection tool selezioni le parti interessate

applichi l'effetto

...se hai da applicare l'effetto su + parti "sparse" lungo il beat,sempre con selection tool selezioni le varie parti tenendo premuto ctrl.

allora vuoi applicare un effetto (quale?) a mettiamo 1 minuto esatto....bene,allora va ok il metodo che ti spiegato sopra....almeno in linea teorica....magari spiega proprio quello che vuoi fare...se vuoi che ne so applicare un fx tipo il pan vai su insert->envelope->pan e poi disegni la curva che vuoi che assuma il tuo fx (con doppio clik sulla linea che si crea assegni un nuovo punto)

se vuoi altri effetti vai su insert->assignabile fx e da li dovresti avere la lista degli fx che hai nel pc....tipo i vst